เชื่อว่าหลายคนคงเคยได้ยินคำว่านาฬิกาชีวิต ซึ่งสิ่งนี้หากมองในมุมวิทยาศาสตร์ทางการแพทย์คือต่อมไพเนียลหรือต่อมใต้สมองของมนุษย์ที่จะคอยจดจำสังเกตว่าสภาพแวดล้อม เปลี่ยนไปลักษณะใดและควรจะมีการกระทำอย่างไร เช่น ในช่วงเวลากลางคืนเราก็จะรู้สึกง่วง และในช่วงเวลากลางวันที่มีแสงจ้าเราจะรู้สึกตื่นตัวซึ่งสิ่งเหล่านี้เป็นผลมาจากต่อมใต้สมอง แน่นอนว่าในการวิ่งออกกำลังกายก็มีช่วงเวลาที่เหมาะสมอยู่เหมือนกัน
ถ้าหากตัดปัญหาเรื่องตารางเวลาในการใช้ชีวิตของแต่ละคนออกไปช่วงเวลาที่เหมาะสมสำหรับมากที่สุดคือช่วงช่วงเย็นในเวลาประมาณ 17:00 น ซึ่งเป็นช่วงเวลาที่ร่างกายก้ำกึ่งอยู่ระหว่างความเหน็ดเหนื่อยและความตื่นตัว แล้วในการวิ่งนั้นจะเป็นการกระตุ้นให้ร่างกายสดชื่นและการวิ่งในช่วงนี้ยังจะได้รับแสงแดดอ่อน ๆ ที่เป็นปัจจัยสำคัญในการย่อยสลายไขมันใต้ผิวหนังให้กลายเป็นวิตามินดีได้อีกด้วย แต่ถ้าไม่สะดวกก็อาจจะเลือกเป็นการวิ่งในช่วงหลังตื่นนอนก็ได้เหมือนกันถึงแม้ว่าในช่วงนี้สภาพร่างกายจะยังไม่ค่อยพร้อมสำหรับการออกกำลังกายอย่างหนักก็ตาม ดังนั้นถ้าหากต้องการวิ่งในช่วงหลังตื่นนอนก่อนวิ่งควรจะดื่มน้ำประมาณ 1 แก้วเพื่อเพิ่มปริมาณน้ำในเลือดหลังจากไม่ได้รับน้ำติดต่อกันเป็นระยะเวลานาน และการวิ่งในช่วงเช้ายังมีข้อดีในเรื่องของอากาศเย็นสบาย สภาพอากาศปลอดโปร่ง
นอกจากช่วงช่วงเย็นและช่วงเวลาตื่นนอนแล้วสำหรับบุคคลที่มีตารางเวลาไม่เป็นปกติอาจจะใช้การวิ่งก่อนนอนก็ได้แต่จะต้องห่างจากเวลาเข้านอนประมาณ 3 ชั่วโมง ทั้งนี้การวิ่งยังจะช่วยให้ร่างกายมีความเหนื่อยล้าและจะทำให้นอนหลับง่ายมากขึ้น